发布日期:2024-09-16 01:11 点击次数:166
“生命科学领域也有我方的‘光刻机’另类图片,那等于基因测序仪。咱们要提赶赴布局,弗成等简直需要的时间倏得发现测序仪工夫蓝本被东谈主家抢在手里。”
2024 年 9 月 9 日,在“登峰探极·生命可测”华大集团生命科学全球新品发布会上,华大集团 CEO、践诺董事尹烨在《生命可测:SEQ ALL》主旨演讲中指出。
那么,华大集团的“光刻机”是什么?今日,华大集团发布了名为 CycloneSEQ 的最新测序工夫,并推出 CycloneSEQ-WT02(下称“WT02”,中语名“梧桐”)和 CycloneSEQ-WY01(下称“WY01”,中语名“五岳”) 两款纳米孔测序仪。同期,其还晓谕成就“SEQ ALL 定约”,并负责发起“探极蓄意”。
这是华大集团的又一台“光刻机”。从 2015 年发布 BGISEQ-500 运转,在短读长测序领域,华大早已兑现中国生命科学领域的“光刻机”的自主研制,推动中国成为了当今“唯二”的掌持全产业链(工夫、装备、阛阓诓骗等)的国度。
(着手:府上图)
鬼父在线观看CycloneSEQ 纳米孔测序仪:能识别上百种病原,已完成上千个物种的单菌拼装图
CycloneSEQ 纳米孔测序仪主要有四个脾气:长、快、小、准。
长指的是:和短读长测序工夫比拟,使用 CycloneSEQ 测序工夫读取的基因序列要长得多,掩饰长度的范围也比较全面。当今最长能达到 Mbp 级别,平均一个基因组测序下来能作念到 30Kbp—50Kbp 的 N50 基因长度,也等于说从短到长都能测。
快指的是:CycloneSEQ 测序仪的单条链过孔速率达到 350nt/s—420nt/s,而且大略进行及时测序,只需测试 10 分钟用户就能拿到饱和多的数据。
小指的是:基于 CycloneSEQ 测序工夫开发的迷惑都唯有手掌心大小,因此具备更高的普及性。
准指的是:通过卵白优化和算法优化,CycloneSEQ 测序仪当今已能达到单次准确率 97% 的水平。
就诓骗才略来讲:
在感染疾病会诊领域,CycloneSEQ 测序平台能赶紧识别各式病原体,比如识别呼吸谈中的上百种病原。
同期,也能在遗传病会诊中针对复杂遗传变异兑现精准检测,比如检测地中海贫血等疾病。
在科研领域,CycloneSEQ 平台也曾完成上千个物种的单菌拼装图,并兑现了多个动植物染色体级别参考基因组图谱的构建。
比如,其曾初次完成鬃狮蜥 Z 染色体的好意思满贯通,从而发现了多数转座单元和频粗重组区域,借此辅导了鬃狮蜥物种的潜在性别决定机制。
濒临极点 GC 含量基因组等工夫挑战,CycloneSEQ 测序仪也能兑现环状基因组的好意思满拼装。当作华大集团的深海测序仪系统之一,它能在极点环境下兑现相识运行,并已能针对水体环境微生物进行原位断然。
对此,华大生命科学掂量院院长、华大集团践诺董事徐讯例如称:“比如从海内部打一碗水,通过曾从水里游过的鱼或微生物的残留 DNA,不错测出在这里到底存在过哪些鱼或微生物,以及不错测出是否因为环境变化或环境欺侮发生了变化。”
此外,联接时空组学和细胞组学器用等多组学器用,CycloneSEQ 测序仪还能提供多维基因组的分析。
会上,在 CyloneSEQ 纳米孔测序仪发布之后,在华大集团荟萃首创东谈主&董事长汪建、以及华大集团践诺董事&华大智造 CEO 牟峰的见证之下,70 多家科研用户代表和临床用户代表、与华大生命科学掂量院领域首席科学家&华大序风总司理董宇亮以及华大智造副总裁&中国区总司理彭欢欢共同签署谐和公约,记号着首批 CycloneSEQ 用户负责达成签约谐和意向。
2024 年 6 月,华大智造也曾取得华大序风纳米孔测序家具的全球阛阓经销权,其中 WT02 将于 2024 年 9 月 9 日起盛开订购,WY01 则将于 2025 年上半年上市。
“梧桐”“五岳”:填补中国在高通量纳米孔测序迷惑的空缺
基于上述 CycloneSEQ 测序工夫,徐讯代表华大集团负责发布了工致便携的 WT02 测序仪和 WY01 测序仪,并在现场针对 8 种微生物完成了及时测试。
他说:“好多东谈主劝我不要在现场作念,最佳预先录个视频。然而咱们昨天作念了四次,都证明相识性极端强,是以咱们极端有信心在现场及时完成。”
细心来说:
WT02,是一款中通量的纳米孔基因测序仪,接管双芯片架构,营救孤独运行,具有天果真通量选定。
全掩饰、快速读、摆脱测是 WT02 的主要上风,这让它不仅大略平淡应酬复杂序列的挑战,而且单次测序本钱低、无需凑样、随测随停,能及时输出测序恶果。
在生命科学领域 WT02 有着平常的诓骗场景:它不仅能快速识别病原微生物而且快速溯源,还能准确好意思满地检测复杂遗传病匡助,更能通过获取基因组图谱来鼓吹生物万般性掂量等。
华大智造首席运营官蒋慧补充称:“WT02 不错作念一些袖珍基因组或靶向基因组的测序,但愿它能成为一款让高校、科研机构、病院、疾控海关等机构都大略垂手而得的迷惑。”
WY01,则是一台高通量纳米孔测序仪,其搭载高通量高密度芯片,不仅具有超长读长和历久续测等性能,更大略全面掩饰复杂基因组序列。
它能用于数据通量需求更高的诓骗场景,比如用于大基因组、东谈主基因组重测序、全长转录组测序和表不雅遗传学检测等。
华大集团暗示,WY01 的多项要道性能均处于全球逾越水平,故能加快关系疾病的掂量和会诊,促进跨学科掂量谐和,并能营救生物万般性和生态学掂量,它的出现填补了国内纳米孔测序领域高通量芯片的空缺。
另据华大集团先容:
在性能参数上,WT02 和 WY01 这两款纳米孔测序仪的测序读长均掩饰百 bp 至 Mbp(1Mbp 等于 10 的 6 次方)级别的读长范围,不错自豪从基础科研到复杂疾病掂量的平常需求。
在测序时长与速率上,用户不错凭阐发验需求在 10 分钟至 72 小时内完成测序,测序速率为 350-420nt/s,每分钟不错产生 10Mb 的数据,而且不错及时获取测序序列恶果。
在测序准确率上,单次测序准确率为 97%,在更深的测序深度下大略兑现 99.99% 的一致性准确率。
此外,WT02 的单芯片孔谈卵白数高达 4092 个,单芯片实验室最大通量达 50Gb(1Gb 等于 10 的 9 次方)。在此基础之上,WT01 单芯片大略提供 8 倍数目的孔卵白,达到 3 万个卵白孔,单芯片数据产量则将擢升到 8 倍。
谈及数据安全问题,蒋慧暗示:“安全问题不是到终末一刻才发现的,咱们在一运转的研发霸术中就把数据安全琢磨在内。”
率先,在针对迷惑开展软件霸术和硬件选型时,就也曾琢磨到安全身分。
其次,华大集团针对信息安全设有故意的治理委员会,并建有相应的数据安举座系,在迷惑后台的算法软件、数据传输、数据存储上都作念了数据罅隙和数据外泄的风险防控动作。
再次,在家具开发经过当中,也会针对家具进行安全认证,比如斯前华大智造的 DNBSEQ 系列测序平台就已拿到中国和国外的数据安全认证。
终末,本次发布的测序仪也都带行状器,不错在不联网、或在局域网之中使用。
“总的来说,当今华大也曾是全球唯独领有长测序+短测序器用的公司,亦然全球唯独一个领有超高通量、超低本钱、以及超长读长测序平台的公司。与此同期,华大当今在纳米孔测序领域也曾兑现了 200 多项的专利部署。”董宇亮回归称。
汪建也在会上暗示:“从激勉光测序仪到自觉光测序仪,再到今天公布的不发光测序仪。三类机器、三种不同旨趣、不同测序形态联接在一块,咱们是全寰宇唯独的一家。”
“而统共迷惑的主要认识等于兑现生命可测。让环球在思测的时间,不会因为器用的问题、不会因为本钱的问题而无法兑现这么的蓄意。”蒋慧暗示。
据她先容,当今已有 50 台—60 台迷惑在客户那边完成装机,其中有一部分属于早期测试用户,涵盖高校、科研机构、疾控单元、医疗机构等。同期,华大集团已有 4 台迷惑通过公开招投标中标。
晓谕成就“SEQ ALL 定约”,并负责发起“探极蓄意”
此外,华大集团还在发布会上荟萃 140 家多科研机构和企业代表,负责晓谕成就“SEQ ALL 定约”,旨在构建盛开、透明的诓骗生态谐和组织,基于“全读长”测序平台及多组学器用,共同推动行业要领的制定与完善。
而之是以叫 SEQ ALL,指的是当东谈主们需要更准确、更长、更快、更好的测序恶果时,不错把 DNBSEQ 和 CycloneSEQ 这两种测序平台作念一个组合,从而兑现理思的测序恶果。
与此同期,尹烨在会上代表华大集团负责发起“探极蓄意”,联袂谐和伙伴共同推动极点环境下的样本收集、科学掂量和产业诓骗。
他暗示:“今天咱们负责发起探极蓄意,让咱们一皆以当然为师、向微生物学习,去看一看咱们的生命之源,也看一看咱们若何把这些大当然 38 亿年的演化精髓付诸在东谈主类坐蓐践诺当中,去治理咱们在生物农业、生物医药、生物环保、生物制造、生物生态一系列的问题。”
与此同期,也正如汪建所言:“不才一个生命时间,咱们完全弗成亦步亦趋,要走出一个新的门道,换一种交通形态。咱们要飞起来,让‘旋风’旋起来,在将来以大数据为基础的生命科学发展、生物经济发展上走出一条引颈寰宇、营救寰宇的发展谈路。”
总的来说,从“给寰宇多一个选定”到“给寰宇更好的选定”,华大集团将进一步通过研发生命解码器用,为衣食住行等东谈主类终极问题陆续提供先进“利器”。
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